Laboratoř nádorové biologie a imunoterapie

Novinky

O nás

Nádorová onemocnění je celosvětově jedna z nejčastějších příčin úmrtí. Podrobné studie v oblasti onkologie přinesly během posledního desetiletí nové možnosti léčby, jako jsou specifické molekulární inhibitory a imunoterapie, pozitivně ovlivňující výsledky pacientů. Navzdory tomuto skvělému pokroku, stále umírá vysoké procento pacientů přímo v důsledku onkologického onemocnění. Pro dosažení lepších výsledků v přežití pacientů jsou proto nové biomarkery a terapie stále hledány.

Laboratoř nádorové biologie a imunoterapie studuje maligní onemocnění, zejména hematologické malignity k identifikaci potencionálních biomarkerů pro zlepšení jejich detekce, predikce a prognózy, identifikování procesů a interakcí, které mohou pomoci k rozvoji, či zlepšení imunoterapie u těchto onemocnění.

 

Zaměřujeme se na:

  • Rozvoj a testování imunoterapií, zejména pro hematologické malignity
  • Studium nádorového mikro-prostředí se zaměřením na imunitní buňky a mezenchymální kmenové buňky
  • Single cell analýzy nádorových a imunitních buněk u hematologických malignit
  • Tekuté biopsie se zaměřením na cell-free RNA v plazmě

 

Naše metody:

  • Zpracování biologických vzorků (kryokonzervace mononukleárních buněk, RNA/DNA izolace a utváření sbírek sér/plazmy)
  • Analýzy exprese (qPCR a hmotnostní spektrometrie)
  • Sekvenování – Sanger, NGS
  • Imunofenotypizace – průtoková cytometrie, imunochemie
  • Kultivace buněčných linií i primárních buněk

 

Používané přístroje:

  • Sekvenování nové generace (MiSeq)
  • Sangerova metoda sekvenování (3500 Genetic Analyzer)
  • qPCR (LightCycler 96 System, CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System)
  • Průtoková cytometrie (BD FACSAria Fusion)
  • Mikroskopie (Olympus IX83 with Yokogawa CSU-W1 confocal head)
  • Zobrazování živých buněk (Incucyte Live-Cell Analysis System)
  • Microarrays – analýza čipů (SureScan Microarray Scanner)
  • Hmotnostní spektrometrie

 

Mezinárodní spolupráce:

  • Prof. Peter Kuhn – USC Michelson Center for Convergent Bioscience, Los Angeles, CA
  • Dr. Valentina Caputo – School of Applied Sciences, London South Bank University, UK
  • Dr. Iros Barozzi – Institute of Cancer Research, Medical University of Vienna, UK
  • Dr. Antonia Rotolo – University of Pennsylvania, University of Pennsylvania, Philadelphia, USA

 

Domácí spolupráce:

  • Hematologicko-onkologické oddělení, Fakultní nemocnice Plzeň
  • Nové technologie pro informační společnost (NTIS), Západočeská univerzita v Plzni
  • Český národní registr dárců dřeně, Plzeň
  • I. interní klinika, Fakultní nemocnice Plzeň
  • SOTIO a.s., Praha

Příbuzná výzkumná témata

Kontakt

Univerzita Karlova
Lékařská fakulta v Plzni
Biomedicínské centrum
alej Svobody 1655/76
323 00 Plzeň – Severní Předměstí

Členové

  • Mgr. Monika Holubová, Ph.D. – vedoucí laboratoře (imunoterapie, průtoková cytometrie)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 104 645
  • Mgr. Pavel Ostašov, Ph.D. – senior researcher (sekvenování, tekuté biopsie)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 593 845
  • Mgr. Pavel Pitule, Ph.D. – post-doc. (qPCR, alternativní sestřih)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 593 845
  • Ing. Iva Machová, Ph.D. – post-doc. (hmotnostní spektrometrie, proteinová analýza)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 593 320
  • MUDr. Miroslava Čedíková, Ph.D. – post-doc. (supervizor pre-graduálních studentů, imunoterapie)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 593 320
  • Eva Kralovcová – laboratorní asistent (laboratorní management, molekulární biologie)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 593 842
  • Bc. Pavlína Mrázová – laboratorní asistent (buněčné kultury, průtoková cytometrie)
    Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., 377 593 842

 

PhD studenti:

  • Mgr. Robin Klieber
  • Mgr. Diana Macečková
  • Mgr. Karolína Dostálová
  • Mgr. Alena Machuldová
  • MUDr. Tereza Dekojová
  • MUDr. Drahomír Kolenčík

 

Externí pracovníci:

  • doc. RNDr. Martin Pešta, Ph.D.
  • Ing. et Ing. Jiří Polívka, Ph.D.

Publikace

  • Machuldova A, Holubova M, Caputo VS, Cedikova M, Jindra P, Houdova L and Pitule P (2021) Role of Polymorphisms of NKG2D Receptor and Its Ligands in Acute Myeloid Leukemia and Human Stem Cell Transplantation. Front. Immunol. 12:651751. doi: 10.3389/fimmu.2021.651751
  • Hlaváč, V., Václavíková, R., Brynychová, V., Ostašov P., Koževnikovová, R., Kopečková, K., Vrána, D., Gatěk, J., & Souček, P. (2021). Role of Genetic Variation in Cytochromes P450 in Breast Cancer Prognosis and Therapy Response. International journal of molecular sciences, 22(6), 2826. https://doi.org/10.3390/ijms22062826
  • Rakova, J., Truxova, I., Holicek, P., Salek, C., Hensler, M., Kasikova, L., Pasulka, J., Holubova, M., Kovar, M., Lysak, D., Kline, J. P., Racil, Z., Galluzzi, L., Spisek, R., & Fucikova, J. (2021). TIM-3 levels correlate with enhanced NK cell cytotoxicity and improved clinical outcome in AML patients. Oncoimmunology, 10(1), 1889822. https://doi.org/10.1080/2162402X.2021.1889822
  • Fiala, O., Sorejs, O., Hosek, P., Liska, V., Vycital, O., Bruha, J., Kucera, R., Topolcan, O., Finek, J., Maceckova, D., & Pitule, P. (2020). Association of miR-125b, miR-17 and let-7c Dysregulations With Response to Anti-epidermal Growth Factor Receptor Monoclonal Antibodies in Patients With Metastatic Colorectal Cancer. Cancer genomics & proteomics, 17(5), 605–613. https://doi.org/10.21873/cgp.20217
  • Ostasov P., Robertson, H., Piazza, P., Datta, A., Apperley, J., Houdova, L., Lysak, D., Holubova, M., Tesarova, K., Caputo, V. S., & Barozzi, I. (2020). Evolution of Advanced Chronic Lymphoid Leukemia Unveiled by Single-Cell Transcriptomics: A Case Report. Frontiers in oncology, 10, 584607. https://doi.org/10.3389/fonc.2020.584607
  • Ostasov, P., Tuma, J., Pitule, P., Moravec, J., Houdek, Z., Vozeh, F., Kralickova, M., Cendelin, J., & Babuska, V. (2020). Sonic Hedgehog and Triiodothyronine Pathway Interact in Mouse Embryonic Neural Stem Cells. International journal of molecular sciences, 21(10), 3672. https://doi.org/10.3390/ijms21103672
  • Tichanek, F., Salomova, M., Jedlicka, J., Kuncova, J., Pitule P., Macanova, T., Petrankova, Z., Tuma, Z., & Cendelin, J. (2020). Hippocampal mitochondrial dysfunction and psychiatric-relevant behavioral deficits in spinocerebellar ataxia 1 mouse model. Scientific reports, 10(1), 5418. https://doi.org/10.1038/s41598-020-62308-0
  • Dekojová, T., Houdová, L., Fatka, J., Pitule, P., Ostašov, P., Caputo, V. S., Gmucová, H., Lysák, D., Jindra, P., & Holubová, M. (2020). Dynamic Changes of Inhibitory Killer-Immunoglobulin-Like Receptors on NK Cells after Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation: An Initial Study. Journal of clinical medicine, 9(11), 3502. https://doi.org/10.3390/jcm9113502
  • Kolenčík, D., Shishido, S. N., Pitule, P., Mason, J., Hicks, J., & Kuhn, P. (2020). Liquid Biopsy in Colorectal Carcinoma: Clinical Applications and Challenges. Cancers, 12(6), 1376. https://doi.org/10.3390/cancers12061376
  • Vycital O, Pitule P, Hosek P, Kriz T, Treska V, Liska V. Expression of Serpin B9 as a Prognostic Factor of Colorectal Cancer. Anticancer Res. 2019 Nov;39(11):6063-6066. doi: 10.21873/anticanres.13813
  • Fiala O, Ostasov P, Hosek P, Sorejs O, Liska V, Buchler T, Poprach A, Kucera R, Topolcan O, Sustr J, Sedivcova M, Finek J. The Predictive Role of Primary Tumour Sidedness in Metastatic Colorectal Cancer Treated With Targeted Agents. Anticancer Res. 2019 Oct;39(10):5645-5652. doi: 10.21873/anticanres.13761
  • Truxova I, Kasikova L, Salek C Hensler M, Lysak D, Holicek P, Bilkova P, Holubova M,……. Spisek R, Fucikova J. Calreticulin exposure on malignant blasts correlates with improved natural killer cell-mediated cytotoxicity in acute myeloid leukemia patients. Haematologica. 2019 Oct 3. pii: haematol.2019.223933. doi: 10.3324/haematol.2019.223933
  • Benjamin M. Tang, Maryam Shojaei, …….., Marek Nalos, Monika Holubova, Tracy Chew, David Booth, Anand Kumar, Anthony McLean & Klaus Schughart. NEUTROPHILS-RELATED HOST FACTORS ASSOCIATED WITH SEVERE DISEASE AND FATALITY IN PATIENTS WITH INFLUENZA INFECTION. Nature Communications,10, Article number: 3422 (2019) , DOI: 10.1038/s41467-019-11249-y
  • Holubova M, Leba M, Gmucova H, Caputo V, Jindra P and Lysak D. Improving the Clinical APPLICATION OF NATURAL KILLER CELLS BY MODULATING SIGNALS SIGNAL FROM TARGET CELLS. Int. J. Mol. Sci. 2019, 20, 3472; doi:10.3390/ijms20143472
  • P.Holicek, I.Truxova, L.Kasikova, S.Vosahlikova, C.Salek, J.Rakova, M.Holubova, D.Lysak, I.Cremer, R.Spiseka, J.Fucikova. ASSESSMENT OF NK CELL-MEDIATED CYTOTOXICITY BY FLOW CYTOMETRY AFTER RAPID, HIGH-YIELD ISOLATION FROM PERIPHERAL BLOOD. Methods in Enzymology. June 2019, doi.org/10.1016/bs.mie.2019.05.034
  • Thiele JA, Pitule P, Hicks J, Kuhn P. SINGLE-CELL ANALYSIS OF CIRCULATING TUMOR CELLS. Methods Mol Biol. 2019;1908:243-264. doi: 10.1007/978-1-4939-9004-7_17
  • Altanerova U, Jakubechova J, Benejova K, Priscakova P, Pesta M, Pitule P, Topolcan O, Kausitz J, Zduriencikova M, Repiska V, Altaner C. PRODRUG SUICIDE GENE THERAPY FOR CANCER TARGETED INTRACELLULAR BY MESENCHYMAL STEM CELL EXOSOMES. Int J Cancer. 2019 Feb 15;144(4):897-908. doi: 10.1002/ijc.31792
  • Miklíková M, Jarkovská D, Čedíková M, Švíglerová J, Kuncová J, Nalos L, Kubíková T, Liška V, Holubová M, Lysák D, Králíčková M, Vištejnová L, Štengl M. BENEFICIAL EFFECTS OF MESENCHYMAL STEM CELLS ON ADULT PORCINE CARDIOMYOCYTES IN NON-CONTACT CO-CULTURE. Physiol Res. 2018 Dec 31;67(Supplementum 4):S619-S631
  • Dejmek J, Kohoutová M, Kripnerová M, Čedíková M, Tůma Z, Babuška V, Bolek L, Kuncová J. REPEATED EXPOSURE TO HYPERBARIC HYPEROXIA AFFECTS MITOCHONDRIAL FUNCTIONS OF THE LUNG FIBROBLASTS. Physiol Res. 2018 Dec 31;67(Supplementum 4):S633-S643
  • Hlavac V, Kovacova M, Elsnerova K, Brynychova V, Kozevnikovova R, Raus K, Kopeckova K, Mestakova S, Vrana D, Gatek J, Ostasov P, Vaclavikova R, Soucek P. Use of Germline Genetic VARIABILITY FOR PREDICTION OF CHEMORESISTANCE AND PROGNOSIS OF BREAST CANCER PATIENTS. Cancers (Basel). 2018 Dec 12;10(12). pii:E511. doi: 10.3390/cancers10120511. PubMed PMID: 30545124
  • Rotolo A, Caputo VS, Holubova M, Baxan N, Dubois O, Chaudhry MS, Xiao X, Goudevenou K, Pitcher DS, Petevi K, Kachramanoglou C, Iles S, Naresh K, Maher J, Karadimitris A. ENHANCED ANTI-LYMPHOMA ACTIVITY OF CAR19-INKT CELLS UNDERPINNED BY DUAL CD19 AND CD1D TARGETING. Cancer Cell. 2018 Oct 8;34(4):596-610. PMID: 30300581
  • Thiele JA, Hosek P, Kralovcova E, Ostasov P, Liska V, Bruha J, Vycital O, Rosendorf J, Opattova A, Horak J, Kralickova M, Vodicka P, Pitule P. LNCRNAS IN NON-MALIGNANT TISSUE HAVE PROGNOSTIC VALUE IN COLORECTAL CANCER. Int J Mol Sci. 2018 Sep 8;19(9). pii: E2672. PubMed PMID: 30205577
  • Polívka J Jr, Pešta M, Pitule P, Hes O, Holubec L, Polívka J, Kubíková T, Tonar Z. IDH1 MUTATION IS ASSOCIATED WITH LOWER EXPRESSION OF VEGF BUT NOT MICROVESSEL FORMATION IN GLIOBLASTOMA MULTIFORME. Oncotarget. 2018 Feb 20;9(23):16462-16476. PMID: 29662659
  • Fikar P, Georgiev V, Lissorgues G, Holubova M, Lysak D, Georgiev D. 2DEP CYTOMETRY: DISTRIBUTED DIELECTROPHORETIC CYTOMETRY FOR LIVE CELL DIELECTRIC SIGNATURE MEASUREMENT ON POPULATION LEVEL. BIOMED MICRODEVICES. 2018 Jan 8;20(1):12

Kontakt

Univerzita Karlova
Lékařská fakulta v Plzni
Biomedicínské centrum

alej Svobody 1655/76
323 00 Plzeň – Severní Předměstí

T: +420 377 593 810
E: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Login

Log in to your account or Vytvořit účet