Monitorace cytomegalovirové specifické imunity a dárcovsky specifické imunity v závislosti na způsobu prevence cytomegalovirové infekce po transplantaci ledviny

Laboratoř transplantace ledvin a náhrady funkce ledvin

odpovědný školitel: doc. MUDr. Tomáš Reischig, Ph.D.; max. počet studentů: 2

V průběhu randomizované studie (OVERT Study) porovnávající cytomegalovirovou profylaxi valganciclovirem s preemptivní léčbou bude stanovována intenzita celulární imunitivní responze specifické vůči dárcovským antigenům a cytomegalovirovým proteinům. Imunitní odpověď bude měřená pomocí techniky ELISPOT na základě stanovení sekrece IFN-γ a IL-2 T lymfocyty. Podstatou příspěvku studenta je spolupráce při laboratorní práci a při zpracování dat.

Studium exprese genů v srdečních gangliových buňkách u diabetických potkanů

Laboratoř laserové mikrodisekce

odpovědný školitel: doc. MUDr. Magdaléna Chottová Dvořáková, Ph.D.; max. počet studentů: 2

Studenti nejdříve u laboratorních potkanů vyvolají diabetes mellitus. Srdce kontrolních a diabetických jedinců zmrazí a připraví tkáňové řezy. Pomocí laserové mikrodisekce vyizolují gangliové buňky, z nichž následně získají RNA. Nakonec prostřednictvím RT-qPCR stanoví úroveň exprese vybraných genů (např. pro neuropeptidy či jejich receptory) a posoudí vliv diabetu na tuto expresi.

Izolace a charakterizace epiteliálních buněk proximálního tubulu ledviny

Laboratoř buněčné regenerativní medicíny

odpovědný školitel: Ing. Lucie Vištejnová, Ph.D.; max. počet studentů: 1

Morfologická a funkční charakteristika buněk proximálního tubulu ledviny izolovaných z moče může sloužit jako účinný nástroj k identifikaci patologických mechanismů při závažných onemocněních včetně sepse. Cílem SVOČ projektu bude zavést metodu izolace těchto buněk, optimalizovat jejich in vitro kultivaci a navrhnout metody jejich charakterizace. V rámci projektu budou používány metody in vitro kultivace buněk, různé mikroskopické přístupy (konfokální a elektronová mikroskopie) či průtoková cytometrie a třídění buněk dle typických proteinových znaků.

Požadavky na uchazeče:

• zájem o práci v laboratoři a ochotu věnovat čas laboratorní práci (2–3 × týdně)
• zájem učit se nové věci
• chuť k tvůrčí a samostatné práci
• porozumění anglickému odbornému textu

Nabízíme:

• zkušenosti s prací v molekulárně biologické laboratoři a s tkáňovými kulturami
• vhled do vědecké práce
• práci v mladém týmu
• možnost finanční odměny

Zavedení 3D in vitro kultivace hepatocytů pro účely vývoje modelu nealkoholové steatózy

Laboratoř buněčné regenerativní medicíny

odpovědný školitel: Ing. Lucie Vištejnová, Ph.D.; max. počet studentů: 1

Hepatocyty je nutné v in vitro podmínkách kultivovat na kolagenové matrici, aby si udržely vlastnosti, které mají v původní tkáni. Cílem projektu bude optimalizovat izolaci a kultivaci hepatocytů v 3D kolagenové matrici a charakterizovat jejich morfologii a funkce za fyziologických a patologických podmínek nealkoholové steatózy. V projektu budou použity metody konfokální mikroskopie, průtokové cytometrie a měření detoxifikačních a metabolických funkcí buněk.

Požadavky na uchazeče:

• zájem o práci v laboratoři a ochotu věnovat čas laboratorní práci (2–3 × týdně)
• zájem učit se nové věci
• chuť k tvůrčí a samostatné práci
• porozumění anglickému odbornému textu

Nabízíme:

• zkušenosti s prací v molekulárně biologické laboratoři a s tkáňovými kulturami
• vhled do vědecké práce
• práci v mladém týmu
• možnost finanční odměny

Sledování vlivu patologického prostředí chronické rány na chování dermálních fibroblastů in vitro

Laboratoř buněčné regenerativní medicíny

odpovědný školitel: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.; max. počet studentů: 1

Dermální fibroblasty jsou jedny z klíčových buněk uplatňujících se v procesu hojení. Cílem této práce bude popsat chování dermálních fibroblastů v patologickém prostředí chronické rány modelované v in vitro podmínkách jak ve 2D, tak i v 3D prostředí. Student si osvojí práci s primárními kulturami dermálních fibroblastů (izolaci, kultivaci), bude sledovat buněčnou morfologii (mikroskopie v procházejícím světle a fluorescenční mikroskopie), životaschopnost a proliferaci (měření dehydrogenázové aktivity, počítání buněk a obrazová analýza, kvantifikace DNA). Další sledované parametry chování fibroblastů, které mohou být součástí této práce dle studentova zájmu a zaměření mohou být: produkce a remodelace kolagenu (ELISA, elektroforéza v polyakrylamidovém gelu, hmotnostní spektrometrie) a prozánětlivé chování fibroblastů (produkce prozánětlivých molekul, aktivace signálních prozánětlivých drah, ELISA). Výstupem bude přehledné zpracování dat, jejich interpretace a prezentace na Studentské vědecké konferenci Lékařské fakulty v Plzni, případně publikace v impaktovaném časopise.

Požadavky na uchazeče: Zájem o práci v laboratoři, schopnost porozumět odbornému textu v angličtině, pečlivost, pracovitost, spolehlivost, možnost docházet do laboratoře 2–3 × týdně (nárazově dle domluvy).